Пилефлебит характеризуется выраженными воспалительными изменениями. При медленно развивающемся тромбозе изменения в крови соответствуют фоновой патологии. В коагулограмме могут наблюдаться повышение содержания фибриногена, увеличение протромбинового индекса (уменьшение протромбинового времени).

Диагностическая чувствительность допплеровского УЗИ превышает 90%. Высокой информативностью характеризуются также КТ и особенно ангиография. Выполнение последней важно при определении возможности и выборе метода инвазивного вмешательства.

Тромбоз воротной вены следует дифференцировать с гипоксическим поражением печени(синонимы: ишемический гепатит, шоковая печень), обусловленным несоответствием между доставкой кислорода к печени и ее потребностью в нем. Причиной гипоксии печени обычно является острая сердечная недостаточность, реже шок или дыхательная недостаточность, то есть состояния, сопровождающиеся нарушением доставки кислорода к органу. Характерно выраженное и в то же время относительно быстро обратимое увеличение активности трансаминаз крови, которое может сопровождаться признаками транзиторной печеночной недостаточности. Коррекция причины гипоксии ведет к нормализации клинико-биохимических параметров. Прогноз определяется основным заболеванием.