Для корректной диагностики гепатита Е важное значение приобретает корректно собранный анамнез, в том числе информация о возможных путешествиях в районы с неблагоприятным эпидемиологическим анамнезом. Также важным является информация о соблюдении правил личной гигиены и наличии подобных заболеваний в окружении. В крови больных диагностируется обычно нерезкое повышение АлАТ и АСТ.
Для окончательной и достоверной постановки диагноза необходимо провести лабораторно-диагностический тест иммуно-ферментного анализа. Исследуемом материалом для данных тестов является венозная кровь или кал. Тест ИФА проводится на обнаружение антител НЕV IgM. Данные антитела обнаруживаются в крови на 10-12 день болезни, что является более поздним, чем при гепатите А. Циркулируют антитела в крови еще 1-2 месяца.
Для окончательной диагностики гепатита А у пациентов, живущих в эпидемиологически благоприятных районах, необходимо провести ПЦР- диагностику с обратной транскриптазой. Данный тест показывает наличие РНК вируса в крови или стуле больного.